中科院广州化学研究所分析测试中心每年为客户提供多项药品报批全项分析和结构确证分析，设备齐全，人员经验丰富，药物结构确证全部顺利通过有关部门审定，是华南地区指定药物化学结构确证分析单位。
主要进行的项目有原料药、药物中间体、新药确证和结构分析鉴定（国内外已有标准品药物或已有标准图谱药物）；食品含量鉴定，化合物成分鉴定，生物蛋白样品分析，氨基酸组成分析，蛋白序列分析等。
主要测试方法包括：红外光谱分析；质谱分析；核磁共振分析；紫外光谱分析；X射线粉末衍射分析；元素分析；热分析（DSC、TG）；旋光分析、化学分析和其它方法。